Theo cáo trạng, Viện KSND tối cao cáo buộc bị can Thượng đã đòi hối lộ số tiền 1,429 tỉ đồng trong quá trình cho thông quan hàng tạm nhập tái xuất.

Cuối tháng 4-2012, bà Nguyễn Phương Hoa, giám đốc Công ty TNHH Khánh Minh (trụ sở tại Lào Cai), đến Chi cục Hải quan Mường Khương gặp ông Thượng đặt vấn đề công ty của bà Hoa sẽ làm dịch vụ cho một số đơn vị có hàng tạm nhập tái xuất qua cửa khẩu Mường Khương; các chủ hàng của Trung Quốc thường nhận hàng ngoài giờ hành chính nên bà Hoa đề nghị ông Thượng tạo điều kiện giúp đỡ. Ông Thượng đồng ý với điều kiện bà Hoa phải chi cho ông Thượng mức tiền 1 triệu đồng/container hàng đông lạnh, tạp hóa; 3 triệu đồng/xe hàng đường kính (gồm 2 container loại nhỏ) và chi cho chi cục mỗi xe 2 triệu đồng.

Sau khi thỏa thuận xong, ông Thượng chỉ đạo Nguyễn Văn Cường phải tiếp nhận và nghiên cứu hồ sơ của Công ty TNHH Khánh Minh nộp để trình lãnh đạo chi cục, giao Cường theo dõi số lượng xe thực xuất và nhận tiền do công ty này đưa, báo cáo lại cho ông Thượng. Theo đó, từ ngày 30-4-2012 đến 11-6-2012, Công ty TNHH Khánh Minh đã làm dịch vụ cho 9 công ty xuất hàng tạm nhập tái xuất qua cửa khẩu Mường Khương được 468 container hàng đông lạnh, tạp hóa và 5 xe hàng đường kính.

Thực hiện yêu cầu của ông Thượng, Công ty TNHH Khánh Minh đã chi 3 lần, tổng cộng 314 triệu đồng cho ông Thượng trong tháng 5-2012.

Tuy nhiên, do bức xúc về việc ông Thượng đòi tiền nên đến tháng 7-2012, bà Hoa tố cáo sự việc đến cơ quan điều tra, trong đó nêu ông Thượng tiếp tục đòi chi 169 triệu đồng.

Đến chiều tối 18-7-2012, bà Hoa chuẩn bị 169 triệu đồng đưa cho ông Thượng. Cơ quan điều tra đã bắt quả tang hành vi nhận hối lộ này của ông Thượng.

Tổng số tiền Công ty TNHH Khánh Minh phải chi là 946 triệu đồng.

Trong vụ án này, cơ quan tố tụng xác định hành vi của bà Hoa và nhân viên tại Công ty TNHH Khánh Minh cấu thành hành vi đưa hối lộ nhưng do chủ động tố cáo đến cơ quan công an trước khi bị phát giác, đã giúp đỡ cơ quan điều tra khám phá vụ án nên không truy cứu trách nhiệm hình sự.

Quá trình điều tra cũng chưa xác định có sự liên quan của các cán bộ Hải quan Mường Khương và lãnh đạo Hải quan Lào Cai.