Điều đáng lo ngại, các bếp ăn tập thể (BATT) là nơi phục vụ từ vài trăm đến vài ngàn lượt người mỗi ngày, trong đó có nhiều bếp khá nhạy cảm dành phục vụ người bệnh, các cháu học sinh...nhưng có tới 36% tổng số bếp ăn tập thể lại chưa có Giấy chứng nhận đủ điều kiện an toàn vệ sinh thực phẩm. Đồng thời có tới 86,5% các bếp ăn chưa kiểm soát ATVSTP từ vùng nguyên liệu; 73% kho bảo quản nguyên liệu không đảm bảo an toàn vệ sinh thực phẩm. Đa số các vi phạm vệ sinh dụng cụ các khay đựng thức ăn đều không đạt tiêu chuẩn vệ sinh, cá biệt một số BATT tại các trường Đại học Y Thái Bình, Đại học Cần Thơ, Bệnh viện Tâm thần Trung ương I đã sử dụng bát chén cũ, sứt mẻ, hoặc đồ nhựa màu để đựng thức ăn.

Theo Thanh tra Bộ Y tế: Các Sở y tế thời gian qua đã quan tâm hơn tới công tác an toàn vệ sinh thực phẩm tại các khu công nghiệp, tuy nhiên tại các bếp ăn ở các bệnh viện lại chưa được quan tâm, nhất là loại hình các bếp ăn từ thiện hoặc tình thường trong bệnh viện. Đây là một loại hình khá phổ biến hoạt động tại các bệnh viện phía Nam, trong khi loại hình này lại có quy mô phục vụ rất đông người là bệnh nhân và người nhà bệnh nhân (bệnh viện đa khoa Cần Thơ phục vụ miễn phí cho 1000 lượt người/ngày) lại chưa được quan tâm đúng mức.