Theo xác minh của cơ quan chức năng, Công ty PVL được giao làm chủ đầu tư dự án chung cư Linh Tây, quận Thủ Đức, TP.HCM, đã được phê duyệt thiết kế gồm 1 tầng hầm và 18 tầng nổi. Đến năm 2011 đã thi công xong phần móng và tầng hầm thì ông Hoàng Ngọc Sáu có tờ trình HĐQT xin phê chuẩn điều chỉnh lên 22 tầng. HĐQT công ty đã có nghị quyết đồng ý cho ký hợp đồng thiết kế cơ sở điều chỉnh phương án 22 tầng làm cơ sở để trình UBND TP.HCM và các cơ quan chức năng phê duyệt.

Sau đó, ông Hoàng Ngọc Sáu ký hợp đồng thuê Công ty cổ phần Thiết kế VN (VNLand) thiết kế cơ sở điều chỉnh dự án với giá hơn 557 triệu đồng, vượt quy định của HĐQT Công ty PVL. Trong khi UBND TP.HCM chưa phê duyệt bản thiết kế cơ sở điều chỉnh thì ông Hoàng Ngọc Sáu đã ký hợp đồng với VNLand thuê đơn vị này thiết kế bản vẽ thi công theo phương án 22 tầng, trị giá hợp đồng hơn 9 tỉ đồng và đã thanh toán hơn 8 tỉ đồng. Tháng 10-2012, UBND TP.HCM có văn bản trả lời không phê duyệt phương án thiết kế nói trên. Hành vi của ông Sáu đã gây thiệt hại cho PVL số tiền hơn 8 tỉ đồng.

Ngoài ra, tại dự án trung tâm thương mại, văn phòng và chung cư An Phú, thuộc phường An Phú, quận 2, TP.HCM do Công ty cổ phần Bất động sản xây lắp dầu khí VN (PVC Land) làm chủ đầu tư, ông Hoàng Ngọc Sáu bị xác định đã có sai phạm trong việc thuê sàn giao dịch bất động sản gây thiệt hại hơn 11,2 tỉ đồng. Cụ thể, PVC Land ký hợp đồng thuê Công ty cổ phần Bất động sản VN quản lý vận hành và khai thác tòa nhà trung tâm thương mại, không bán, không cho Công ty cổ phần Bất động sản VN thuê bất cứ phần diện tích nào tại dự án này.

Ngày 25-4-2012, Công ty PVC Land ký biên bản tạm bàn giao khối chung cư cho Công ty cổ phần Bất động sản VN để phục vụ việc quản lý vận hành tòa nhà. Tuy nhiên, từ trước đó hơn một năm, ông Hoàng Ngọc Sáu đã ký hợp đồng thuê hơn 1.000m2 trong số hơn 92.000m2 của dự án để làm sàn giao dịch bất động sản với giá thuê 8.720 USD/tháng, thời hạn thuê trong năm năm. PVL đã thanh toán cho Công ty cổ phần Bất động sản VN hơn 11,2 tỉ đồng.

Ngày 15-5-2012, Công ty cổ phần Bất động sản VN mới ký bàn giao diện tích thuê cho PVL. Tuy nhiên, trên thực tế không có diện tích nào của dự án chung cư này mà Công ty cổ phần Bất động sản VN thuê rồi cho PVL thuê lại làm sàn giao dịch bất động sản. Hành vi của ông Hoàng Ngọc Sáu gây thiệt hại hơn 11,2 tỉ đồng của công ty.