Căn cứ báo cáo của thanh tra Bộ GTVT và Tổng công ty Đường sắt VN (ĐSVN), ông Đinh La Thăng đồng ý với các hình thức xử lý kỷ luật do ĐSVN đưa ra. Cụ thể: buộc thôi việc tổ trưởng hóa vận ga Diêu Trì Nguyễn Xuân Bình, cách chức trưởng ga Diêu Trì Lê Đình Thọ do để xảy ra vụ việc nghiêm trọng trong đơn vị mình quản lý.

Bên cạnh đó, áp dụng hình thức kỷ luật cảnh cáo, kéo dài thời hạn nâng lương không quá sáu tháng, đồng thời không bố trí làm nhiệm vụ, chức danh có liên quan đến công tác phục vụ khách hàng đối với các trường hợp Nguyễn Bình Minh - trực ban chạy tàu ga Quảng Ngãi (thuộc Xí nghiệp vận tải đường sắt Nghĩa Bình), Bùi Hữu Chương (trực ban chạy tàu kiêm hóa vận ga Tuy Hòa, thuộc Xí nghiệp vận tải đường sắt Phú Khánh), Nguyễn Tiến Phúc (nhân viên hóa vận ga Nha Trang).

Mức kỷ luật khiển trách được áp dụng với các trường hợp: Bùi Văn Hải - trưởng ga Quảng Ngãi, Trần Kỳ Thạnh - trưởng ga Tuy Hòa, Nguyễn Đức Mạnh - trưởng ga Nha Trang, Nguyễn Văn Miên - phó trưởng ga Diêu Trì, Nguyễn Văn Bình - phó trưởng phòng kế hoạch kỹ thuật - an toàn vận tải ga Diêu Trì, Cao Minh Hỷ - giám đốc Xí nghiệp vận tải đường sắt Nghĩa Bình, Nguyễn Đình Tân - giám đốc Xí nghiệp vận tải đường sắt Phú Khánh.

Bộ trưởng Đinh La Thăng cũng yêu cầu ĐSVN chỉ đạo Công ty Vận tải hành khách đường sắt Sài Gòn triển khai việc xử lý các hình thức kỷ luật nêu trên và tổ chức rút kinh nghiệm trong toàn tổng công ty, đặc biệt trong các công ty vận tải, tuyệt đối không để xảy ra các trường hợp tương tự.