Theo kết luận thanh tra của UBND TP Thanh Hóa, Phòng GD-ĐT TP Thanh Hóa có công văn chỉ đạo về việc phân luồng học sinh sau tốt nghiệp THCS nêu rõ: đối với Trường trung cấp nghề số 1 TP Thanh Hóa, nếu học sinh có nhu cầu học văn hóa (học sinh phân luồng của TP), yêu cầu nhà trường phối hợp với Trung tâm giáo dục thường xuyên (TTGDTX) TP Thanh Hóa tổ chức dạy văn hóa cho học sinh. Học bạ hệ bổ túc của học sinh được lập, quản lý tại TTGDTX.

Dù đã có sự chỉ đạo của cấp trên nhưng Trường trung cấp nghề số 1 TP Thanh Hóa không ký hợp đồng phối hợp với TTGDTX TP để giảng dạy văn hóa. Trường trung cấp nghề số 1 TP tự ý lên lịch, thời khóa biểu, bố trí giáo viên giảng dạy chương trình văn hóa từ tháng 9-2015, làm học sinh bị chậm chương trình học cả tháng.

Bên cạnh đó, đầu năm 2015 hiệu trưởng nhà trường còn có quyết định thành lập ba lớp sơ cấp cơ khí hàn công nghệ cao với tổng số 97 học viên.

Theo kế hoạch, khóa học sẽ diễn ra trong ba tháng, bắt đầu từ ngày 18-4, kết thúc ngày 18-7. Tuy nhiên, trong quá trình học mới đến ngày 22-6, học viên chưa học xong hết chương trình theo quy định nhưng hiệu trưởng nhà trường vẫn ký quyết định cấp, phát chứng chỉ học nghề cho 71 học viên.

Trong số 71 học viên được nhận chứng chỉ, có 30 học viên là học thật, số còn lại không học hoặc chỉ học một vài ngày nhưng vẫn được cấp chứng chỉ.

Ngoài ra, ông Trịnh Văn Ngãi còn có sai phạm liên quan đến việc tuyển dụng hợp đồng lao động, quản lý kinh tế, quản lý tài sản công tại nhà trường...